本記事では、RDKitを使って原子が色分けされていない単色の分子を描画する方法について記載します。
いろいろな記事で分子の描画方法については記載があったのですが、原子の色を調整する方法は載っていなかった&やり方にたどり着くまで試行錯誤が必要だったのでまとめることにしました。
処理としては1行で済むので簡単です。

私はいつも年末年始に一年間で購入した書籍をPDF化（自炊）して処分・整理しています（Kindleで売られていない書籍はまだまだ多いです）。
そこでこの記事では私が書籍の自炊をする際に使用している道具・アプリの紹介と手順をまとめていきます。

Overleafで論文のやり取りをする際、有料版でないとコメント機能が使えないです。そのためlatexからwordファイルに変換したいと思い調べました。
いくつかの方法（latex2rtf, pandoc, GrindEQ）がよくヒットしますが、一番シンプルかつ他にも汎用性のあると感じた方法を以下に記載します。

ローカルPCではスペック不足のため、計算資源豊富なリモートサーバーでjupyter notebookを使いたいと思う人は結構いると思います。
この記事ではそのためのjupyter notebookの設定方法について記載します。

(2020/05/13 パスワードの設定を追記しました。)

普段私はpyenv + pyenv-virtualenvの組み合わせでpythonの環境管理をしています。今回の記事ではその設定方法について記載していきます。
記事中のコードを手元で実行すれば簡単にpyenv・pyenv-virtualenvの環境が設定できます。

ケムインフォを中心に創薬関連の研究している学生です。
このブログには備忘録的に以下に関連するトピックを不定期にまとめていくつもりです。

• Chemoinformatics
• Machine Learning
• Programming
• etc.

私についてはこちらを参照ください。